Ondernemers kunnen tegen elk besluit van het RVO aangaande de TVL, bezwaar aantekenen. Ieder bezwaar wordt na toetsing, in behandeling genomen door een jurist van het RVO. Deze is verantwoordelijk voor de tijdige afhandeling van het bezwaar. Er is een vertraging in de afhandeling van de bezwaren. Het RVO probeert de komende maanden een inhaalslag te maken.
Op de site van het RVO staat uitgebreide informatie over de bezwaarprocedure.